{"id":66882,"date":"2023-03-18T00:00:28","date_gmt":"2023-03-18T03:00:28","guid":{"rendered":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/?p=66882"},"modified":"2023-03-17T21:41:57","modified_gmt":"2023-03-18T00:41:57","slug":"investigacion-metagenomica-que-lidera-laboratorio-uda-permite-escanear-aguas-residuales-en-busqueda-de-patogenos","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/?p=66882","title":{"rendered":"Investigaci\u00f3n metagen\u00f3mica que lidera Laboratorio UDA permite escanear aguas residuales en b\u00fasqueda de pat\u00f3genos"},"content":{"rendered":"<p><strong>Investigador de la Facultad de Medicina de la Universidad de Atacama mostr\u00f3 en el Congreso de la Sociedad Chilena de Microbiolog\u00eda (SOMICH) que el an\u00e1lisis de metagen\u00f3mica permite detectar variables predominantes de virus sin testeos individuales de personas infectadas.<\/strong><\/p>\n<p>Se trata del director t\u00e9cnico del Laboratorio de Biolog\u00eda Molecular, Dr. C\u00e9sar Echeverr\u00eda, quien explic\u00f3 que dentro del Consorcio de Laboratorios Universitarios de An\u00e1lisis de Aguas Residuales, en el cual la UDA hace parte: \u201cNosotros organizamos un simposio dentro del Congreso de la SOMICH, en el cual todos los investigadores principales de cada uno de los laboratorios universitarios de aguas residuales participamos y expusimos nuestros datos de an\u00e1lisis de aguas residuales. Y en lo particular nos toc\u00f3 mostrar los datos que hemos tenido de an\u00e1lisis metagen\u00f3mico de aguas residuales en los cuales detectamos la presencia de las variantes de SARS-CoV-2\u201d.<\/p>\n<h2 style=\"text-align: center;\"><strong>Metagen\u00f3mica<\/strong><\/h2>\n<p>En palabras del Dr. C\u00e9sar Echeverr\u00eda la t\u00e9cnica de metagen\u00f3mica, es la genotipificaci\u00f3n o la secuenciaci\u00f3n completa de distintos tipos de organismos en una muestra, permite secuenciar toda una muestra completa. \u201cEl genoma de un organismo u organismos que se quiere establecer, o sea, lo que se busca es ver todos los organismos de un target en particular,\u00a0 por ejemplo todos los organismos de una familia de pat\u00f3genos, virus o de bacterias totales en una muestra, no s\u00f3lo SARS-CoV2. Toda esa cantidad de datos que tienes de genoma los ingresas un software, el software dice cu\u00e1les son cada una de las variantes, en este caso de SARS-CoV2 que hay en esa muestra o dice cu\u00e1les son las cepas o variantes de virus o bacterias que hay en esta muestra\u201d.<\/p>\n<p>El investigador universitario asever\u00f3 que hoy en d\u00eda la Universidad de Atacama es la \u00fanica Universidad en Chile y en Sudam\u00e9rica que est\u00e1 realizando an\u00e1lisis de metagen\u00f3mica de aguas residuales. Y \u00e9sta es una herramienta muy poderosa porque nos permite identificar no s\u00f3lo la presencia de SARS-CoV2 en aguas residuales, sino que establecer cu\u00e1l es el porcentaje de variantes del virus que est\u00e1n presente en una comuna\u201d.<\/p>\n<p>Dado el an\u00e1lisis de las muestras que se extraen desde las plantas de tratamiento y alcantarillados en una labor articulada con la empresa sanitaria Nueva Atacama y la Seremi de Salud de Atacama, por ejemplo, \u201cpodemos saber en qu\u00e9 porcentaje est\u00e1 cada una de las variantes circulando en cada una de las comunas, sin la necesidad de tener que estar testeando a todas las personas que est\u00e1n positivas. Entonces esto nos genera un indicador muy certero de c\u00f3mo est\u00e1 circulando el virus SARS-CoV2 en toda nuestra regi\u00f3n, en cada una de nuestras comunas\u201d, explic\u00f3 el Dr. Echeverr\u00eda.<\/p>\n<p>Cabe se\u00f1alar, de acuerdo a lo manifestado por el cient\u00edfico que la informaci\u00f3n del meta an\u00e1lisis a\u00fan no forma parte de los reportes de COVID-19 del Ministerio de Salud, puesto que la prevalencia de las variantes del virus se determina seg\u00fan el reporte de secuenciaci\u00f3n de personas que realiza el laboratorio; \u201cla metagen\u00f3mica se la enviamos tambi\u00e9n el ISP (Instituto de Salud P\u00fablica) como un insumo para ellos tener el dato y hemos tenido reuniones de colaboraci\u00f3n, cual le hemos explicado las cualidades de este an\u00e1lisis. Y \u00faltimamente ya nos hemos estado reuniendo como consorcio de aguas residuales con el Ministerio de Salud, en la cual se estableci\u00f3 el cronograma de trabajo para que para el a\u00f1o 2024 el an\u00e1lisis de\u00a0 aguas residuales se ha tomado como un indicador epidemiol\u00f3gico para la toma de decisiones de salud p\u00fablica\u201d, detall\u00f3 C\u00e9sar Echeverr\u00eda.<\/p>\n<p>\u201cEstamos muy orgullosos como universidad de poder participar en esta iniciativa que es novedosa en nuestro pa\u00eds, que es el uso de aguas residuales como un indicador epidemiol\u00f3gico en la cual vamos a generar los protocolos e informes que se van a entregar al ministerio y la canalizaci\u00f3n a trav\u00e9s Seremi de Salud locales para la entrega de estos antecedentes, los cuales tambi\u00e9n van a ser utilizado como una variable en la toma de decisiones de salud p\u00fablica.<\/p>\n<h2 style=\"text-align: center;\"><strong>Recursos involucrados<\/strong><\/h2>\n<p>Cabe se\u00f1alar que actualmente el laboratorio universitario de la UDA cuenta con una infraestructura de an\u00e1lisis molecular y que a\u00f1adi\u00f3 equipamiento para el desarrollo de investigaci\u00f3n metagen\u00f3mica, al respecto Echeverr\u00eda coment\u00f3: \u201cSomos el \u00fanico laboratorio de la Macro Zona Norte que tiene estos dos mundos en un mismo lugar. Lograrlo ha sido muy complejo y eso ha sido posible partir de donaciones y entrega de recursos del Gobierno Regional, de la empresa privada, de la misma CDC (Centers for Disease Control and Prevention) de Estados Unidos, que vino a visitarnos y nos entreg\u00f3 recursos\u00a0 por casi 40 millones de pesos en reactivos para que el laboratorio gen\u00f3mico funcionaria y son los reactivos que nosotros hemos estado ocupando para hacer tanto b\u00fasqueda de variantes, hemos tenido apoyo de Nueva Atacama que el cual nos entregan las muestras semana a semana para nosotros realizar los estudios\u201d.<\/p>\n<p>El Director T\u00e9cnico del Laboratorio de Biolog\u00eda Molecular y Gen\u00f3mica de la UDA inform\u00f3 la adjudicaci\u00f3n de dos proyectos FIC (Fomento a la Innovaci\u00f3n y Competitividad), \u201clos cuales permitir\u00e1n al laboratorio universitario funcionar en los pr\u00f3ximos dos a\u00f1os y estar alerta a cualquier emergencia sanitaria que tenga la regi\u00f3n en casos de salud p\u00fablica para prestar ayuda en el diagn\u00f3stico oportuno de las muestras que sean sospechosos, por ejemplo de gripe aviar\u201d, a\u00f1adi\u00f3 Echeverr\u00eda.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Investigador de la Facultad de Medicina de la Universidad de Atacama mostr\u00f3 en el Congreso de la Sociedad Chilena de Microbiolog\u00eda (SOMICH) que el an\u00e1lisis&hellip; <\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[38],"tags":[],"class_list":["post-66882","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-portada-regional"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/66882","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=66882"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/66882\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":66884,"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/66882\/revisions\/66884"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=66882"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=66882"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.radioamigavallenar.cl\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=66882"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}